دکتر عسگرخانی به صورت تخصصی بر روی معاهدات بین‌المللی، امنیت بین‌الملل، حوزه انرژی هسته‌ای و سازمان ملل تحقیق و پژوهش می‌کرد. به همین دلیل کتاب‌ها و مقالاتش نیز در همین حوزه‌هاست. از جمله مهمترین تالیفات او می‌توان به «رژیم‌های بین‌المللی» اشاره کرد. در زمره دیگر تالیفات او «همکاری و منازعه در رژیم‌های بین‌المللی فضای ماوراء جو»، «سیاست خارجی چین در برابر آمریکا» و ... جای می‌گیرد. دکتر عسگرخانی معتقد بود «قدرت‌های بزرگ بی‌میل نیستند که جنگی دیگر در منطقه روی دهد به مانند کاری که در دهه ۱۹۸۰ میان ایران و عراق کردند». «آن‌ها در شرایط کنونی می‌خواهند منابع ایران و عربستان به تحلیل برود. در دهه ۱۹۸۰ دستاورد در این بود که هر ۲ طرف ضعیف شوند اما در اینجا دستاورد دیگری را دنبال می‌کنند». او پیش‌بینی می‌کرد «آینده منطقه خاورمیانه آینده‌ای است که برای منطقه پیامدهای سنگینی خواهد داشت.»

از ابومحمد عسگرخانی سه کتاب در زمینه رژیم‌های بین‌المللی به زبان فارسی منشر شده‌است. او همچنین در طول فعالیت علمی خود ۲۵ مقاله به زبان‌های فارسی و انگلیسی متشر کرده بود.

کتاب‌های عسگرخانی عبارت‌اند از:

رژیم‌های بین‌المللی. عسگرخانی ابومحمد ۱۳۹۵

نگرش‌ها و رژیم‌های نوپدید در محیط بین‌المللی خلع سلاح و کنترل تسلیحات. ساعد نادر، عسگرخانی ابومحمد ۱۳۹۲

همکاری و منازعه در رژیمهای بین‌المللی فضای ماوراء جو. عسگرخانی ابومحمد، پوپک محبعلی ۱۳۹۱

او برخلاف استدلال‌های سنتی درباره دولت‌های خاورمیانه معتقد بود «حاکمیت‌های کشورهای منطقه خاورمیانه حاکمیت‌های مقتدری نیستند، حاکمیت‌های قدرتمندی نیستند، حاکمیت‌هایی هستند که به اصطلاح بلوک‌های قدرت در آنها موثر است، حاکمیت‌ها در مقابل آن بلوک‌های قدرت کاملا ضعیف هستند. این بلوک‌های قدرت کاملا مرتبط هستند با قدرت‌های بزرگ یک کشور». پس مصیبت ملت‌های خاورمیانه را دارای دو منشا می‌دانست یکی «مصیبتی که بیرونی است و قدرت‌های بزرگ هستند و دیگری مصیبت داخلی که بلوک‌های قدرت در داخل منطقه هستند»

در چنین شرایطی دکتر عسگرخانی بهترین نسخه‌ای که برای کشورهای خاورمیانه تجویز می‌کرد تا از این وضعیت خارج شوند، این بود که «در داخل خودشان ائتلاف‌هایی تشکیل دهند. ائتلاف‌ها بین بلوک‌های قدرت حاکمیت و دیگر بلوک‌ها و گروه‌ها»